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El nuevo modelo de computadora puede predecir cómo se propaga COVID-19 en las ciudades


Un estudio de cómo 98 millones de estadounidenses se mueven cada día sugiere que la mayoría de las infecciones ocurren en sitios “superpreaders” y detalla cómo los patrones de movilidad ayudan a impulsar tasas de infección más altas entre las poblaciones minoritarias y de bajos ingresos.

Un equipo de investigadores ha creado un modelo informático que predijo con precisión la propagación de COVID-19 en 10 ciudades importantes esta primavera mediante el análisis de tres factores que impulsan el riesgo de infección: adónde van las personas en el transcurso del día, cuánto tiempo permanecen y cuántas otras personas visitan el mismo lugar al mismo tiempo.

“Construimos un modelo de computadora para analizar cómo personas de diferentes orígenes demográficos y de diferentes vecindarios visitan diferentes tipos de lugares que están más o menos concurridos. Basándonos en todo esto, pudimos predecir la probabilidad de que se produzcan nuevas infecciones en cualquier lugar o momento ”, dijo Jure Leskovec, el científico informático de Stanford que dirigió el esfuerzo, que involucró a investigadores de Northwestern University.

Compensación de COVID entre infecciones y actividad

Un nuevo modelo informático predice la relación entre infección y actividad de COVID-19 para Chicago. Según la figura, las infecciones por COVID-19 aumentarán a medida que el número de visitas a comercios y lugares públicos se acerque a niveles prepandémicos. Sin embargo, restringir la ocupación máxima puede lograr un equilibrio efectivo: por ejemplo, un límite de ocupación del 20 por ciento aún permitiría el 60 por ciento de las visitas prepandémicas y arriesgaría solo el 18 por ciento de las infecciones que ocurrirían si los lugares públicos reabrieran por completo. Crédito: Serina Yongchen Chang

El estudio, publicado el 10 de noviembre de 2020 en la revista Naturaleza, combina datos demográficos, estimaciones epidemiológicas e información anónima de ubicación de teléfonos celulares, y parece confirmar que la mayoría de las transmisiones de COVID-19 ocurren en sitios de “superpropagación”, como restaurantes de servicio completo, gimnasios y cafés, donde las personas permanecen en lugares cerrados durante períodos prolongados . Los investigadores dicen que la especificidad de su modelo podría servir como una herramienta para que los funcionarios ayuden a minimizar la propagación de COVID-19 a medida que reabren negocios al revelar las compensaciones entre nuevas infecciones y pérdida de ventas si los establecimientos abren, digamos, al 20 o 50 por ciento de su capacidad. .

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El coautor del estudio, David Grusky, profesor de sociología en la Facultad de Humanidades y Ciencias de Stanford, dijo que esta capacidad predictiva es particularmente valiosa porque proporciona nuevos conocimientos útiles sobre los factores detrás de las tasas de infección desproporcionadas de las minorías y las personas de bajos ingresos. “En el pasado, se suponía que estas disparidades eran impulsadas por condiciones preexistentes y un acceso desigual a la atención médica, mientras que nuestro modelo sugiere que los patrones de movilidad también ayudan a impulsar estos riesgos desproporcionados”, dijo.

Grusky, quien también dirige el Centro Stanford sobre Pobreza y Desigualdad, dijo que el modelo muestra cómo la reapertura de negocios con límites de ocupación más bajos tiende a beneficiar más a los grupos desfavorecidos. “Debido a que los lugares que emplean a minorías y personas de bajos ingresos a menudo son más pequeños y están más abarrotados, los límites de ocupación en las tiendas reabiertas pueden reducir los riesgos que enfrentan”, dijo Grusky. “Tenemos la responsabilidad de elaborar planes de reapertura que eliminen, o al menos reduzcan, las disparidades que están creando las prácticas actuales”.

Leskovec dijo que el modelo “ofrece la evidencia más sólida hasta ahora” de que las políticas de permanencia en el hogar promulgadas esta primavera redujeron la cantidad de viajes fuera del hogar y desaceleraron la tasa de nuevas infecciones.

Siguiendo pasos

El estudio rastreó los movimientos de 98 millones de estadounidenses en 10 de las áreas metropolitanas más grandes del país a través de medio millón de establecimientos diferentes, desde restaurantes y gimnasios hasta tiendas de mascotas y concesionarios de automóviles nuevos.

El equipo incluyó a las estudiantes de doctorado de Stanford Serina Chang, Pang Wei Koh y Emma Pierson, que se graduaron este verano, y las investigadoras de la Universidad Northwestern Jaline Gerardin y Beth Redbird, que recopilaron datos del estudio para las 10 áreas metropolitanas. En orden de población, estas ciudades incluyen: Nueva York, Los Ángeles, Chicago, Dallas, Washington, DC, Houston, Atlanta, Miami, Filadelfia y San Francisco.

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SafeGraph, una empresa que agrega datos de ubicación anonimizados de aplicaciones móviles, proporcionó a los investigadores datos que muestran cuáles de las 553.000 ubicaciones públicas, como ferreterías y establecimientos religiosos, visitaban la gente cada día; por cuanto tiempo; y, lo que es más importante, cuál era la superficie cuadrada de cada establecimiento para que los investigadores pudieran determinar la densidad de ocupación por hora.

Los investigadores analizaron los datos del 8 de marzo al 9 de mayo en dos fases distintas. En la fase uno, alimentaron su modelo de datos de movilidad y diseñaron su sistema para calcular una variable epidemiológica crucial: la tasa de transmisión del virus en una variedad de circunstancias diferentes en las 10 áreas metropolitanas. En la vida real, es imposible saber de antemano cuándo y dónde una persona infecciosa y susceptible entra en contacto para crear una posible nueva infección. Pero en su modelo, los investigadores desarrollaron y perfeccionaron una serie de ecuaciones para calcular la probabilidad de eventos infecciosos en diferentes lugares y momentos. Las ecuaciones pudieron resolver las variables desconocidas porque los investigadores alimentaron a la computadora con un hecho conocido importante: cuántas infecciones de COVID-19 se informaron a los funcionarios de salud en cada ciudad cada día.

Los investigadores refinaron el modelo hasta que pudo determinar la tasa de transmisión del virus en cada ciudad. La tasa varió de una ciudad a otra dependiendo de factores que van desde la frecuencia con la que las personas se aventuran a salir de la casa hasta los tipos de lugares que visitan.

Una vez que los investigadores obtuvieron las tasas de transmisión para las 10 áreas metropolitanas, probaron el modelo durante la fase dos pidiéndole que multiplicara la tasa de cada ciudad con su base de datos de patrones de movilidad para predecir nuevas infecciones por COVID-19. Las predicciones siguieron de cerca los informes reales de los funcionarios de salud, lo que les dio a los investigadores confianza en la confiabilidad del modelo.

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Predecir infecciones

Al combinar su modelo con los datos demográficos disponibles en una base de datos de 57,000 grupos de bloques censales (vecindarios de 600 a 3,000 personas), los investigadores muestran cómo las personas de minorías y de bajos ingresos salen de casa con más frecuencia porque sus trabajos lo requieren, y compran en tiendas más pequeñas y más pequeñas. establecimientos abarrotados que las personas con ingresos más altos, que pueden trabajar desde casa, usar la entrega a domicilio para evitar las compras y patrocinar negocios más espaciosos cuando salen. Por ejemplo, el estudio reveló que es aproximadamente el doble de riesgoso para las poblaciones no blancas comprar comestibles en comparación con los blancos. “Al fusionar conjuntos de datos de movilidad, demográficos y epidemiológicos, pudimos usar nuestro modelo para analizar la efectividad y equidad de diferentes políticas de reapertura”, dijo Chang.

El equipo ha puesto sus herramientas y datos a disposición del público para que otros investigadores puedan replicar y aprovechar los hallazgos.

“En principio, cualquier persona puede utilizar este modelo para comprender las consecuencias de las diferentes decisiones de política de cierre de empresas y de quedarse en casa”, dijo Leskovec, cuyo equipo ahora está trabajando para desarrollar el modelo en una herramienta fácil de usar para los responsables políticos y la salud pública. funcionarios.

Referencia: “Los modelos de red de movilidad de COVID-19 explican las desigualdades e informan la reapertura” por Serina Chang, Emma Pierson, Pang Wei Koh, Jaline Gerardin, Beth Redbird, David Grusky y Jure Leskovec, 10 de noviembre de 2020, Naturaleza.
DOI: 10.1038 / s41586-020-2923-3

Jure Leskovec es profesor asociado de informática en Stanford Engineering, miembro de Stanford Bio-X y del Instituto de Neurociencias Wu Tsai. David Grusky es profesor Edward Ames Edmonds en la Facultad de Humanidades y Ciencias y miembro principal del Instituto de Stanford para la Investigación de Políticas Económicas (SIEPR).

Esta investigación fue apoyada por la National Science Foundation, la Stanford Data Science Initiative, el Wu Tsai Neurosciences Institute y el Chan Zuckerberg Biohub.

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